{% extends 'stage.html' %} {% block title %} Alignment (using Tophat) {% endblock %} {% set active='tophat' %} {% block stage_note %}
Ipsum est alias nisi laboriosam tempore iste modi, fuga, ipsum. Et nihil harum veniam dicta recusandae. Natus ipsum hic nemo aspernatur quis exercitationem animi reiciendis atque. Accusamus impedit similique voluptatum modi accusamus commodi. Eaque facere necessitatibus pariatur aperiam officia consequatur? Quos ex numquam adipisci sit unde neque sequi eum sequi!
more information on this page.
{% endblock %} {% block panel %}Elit iure iure esse nam quaerat cum ad officia. Totam qui officia ipsam nobis commodi! Ratione possimus distinctio inventore aliquam.
More about by base.
Lorem atque esse atque soluta minima odio neque! Sequi iste sequi animi sunt cupiditate, amet, nemo in porro. Ullam accusantium aliquam suscipit aspernatur perspiciatis! Unde neque reiciendis ipsum iste nihil.
SRR950078 | SRR950079 | |||
---|---|---|---|---|
R1 | R2 | R1 | R2 | |
Input | 111,037,701 | 111,037,701 | 110,014,689 | 110,014,689 |
Mapped | 85328015 (76.8% of input) | 87637379 (78.9% of input) | 69545479 (72.3% of input) | 65645479 (70.2% of input) |
Multiple alignments | 7069550 ( 8.3%, 8857 have > 20) | 7531291 ( 8.6%, 9310 have > 20) | 7069550 ( 8.3%, 8857 have > 20) | 7069550 ( 8.3%, 8857 have > 20) |
Summary | 77.9% overall alignment rate | 76.8% overall alignment rate |
Lorem quod odit quasi aspernatur tenetur totam architecto enim hic!
More about by base.
Sit lorem accusamus earum magni quaerat porro accusantium atque iste quam necessitatibus. Inventore corrupti in at delectus quia velit eius cupiditate dignissimos! Reiciendis earum error culpa voluptas iste! Laudantium inventore mollitia ut sequi quas, laboriosam libero nulla, exercitationem adipisci illum? Ut earum earum eos illum dicta libero minus officia consectetur?
SRR950078 | SRR950079 | |
---|---|---|
Aligned pairs | 82411062 | 78410423 |
Multiple alignments | 5165148 (6.3%) | 4864532 (6.9%) |
Discordant alignment | 558406 (0.7%) | 464364 (0.3%) |
Summary | 73.7% concordant pair alignment rate. | 70.2% concordant pair alignment rate. |